Особенности кристаллической структуры и токсичности полиморфных модификаций родентицидной субстанции «дифенацин»

Cover Page

Cite item

Full Text

Open Access Open Access
Restricted Access Access granted
Restricted Access Subscription Access

Abstract

По оригинальным методикам получены две новые полиморфные формы (I и II) 2-(дифенилацетил)индандиона-1,3 (C23H16O3, «дифенацин», ДФ). Кристаллические структуры полиморфных форм, расшифрованные с помощью метода РСА (рентгеноструктурного анализа), сравнили с известной модификацией (III). Структура последней была повторно выделена и исследована при низкой температуре. Кристаллографические параметры полиморфных форм ДФ: (I) – пр.гр. Pna21: a = 8.549(2), b = 35.323(7), c = 5.803(1) Å, Z = 4; (II) – пр.гр. P 21/c: a = 25.856(1), b = 12.363(1), c = 16.081(1) Å, β = 94.00(1)°, Z = 12; (III) – пр.гр. P 21/n: a = 10.365(2) Å, b = 12.239(2) Å, c = 13.227(2) Å, β = 95.83(1)°, Z = 4. Съемка образцов (I) и (II) осуществлена при комнатной температуре, для (III) – при 173 К. Установлено, что число независимых молекул в полиморфах различно: для (I) и (III) – одна молекула и три независимые молекулы в полиморфе (II). В кристаллах дифенацина конформация нейтральных молекул C23H16O3 стабилизирована внутримолекулярной водородной связью с локализацией енольного протона возле атома кислорода кетогруппы ацильного фрагмента. В кристаллических упаковках модификаций обнаруживаются различные наборы контактов С–Н…О одновременно с образованием межмолекулярных π–π-стэкинг-взаимодействий индандионатных фрагментов, при этом межплоскостные расстояния варьируются от 3.50 до 3.65 Å. Сделан вывод о том, что молекула C23H16O3 не содержит хирального центра, однако в кристаллах фенильные группы в ацильном заместителе неэквивалентны, что должно приводить к оптической активности (стереоизомеры в равных количествах). Эффективность полиморфных форм оказалась близкой при одинаковой дозировке 2.28 мг/кг для белых крыс.

Full Text

Restricted Access

About the authors

А. Н. Кочетов

Российский технологический университет – МИРЭА

Author for correspondence.
Email: kochchem@mail.ru
Russian Federation, Москва

Л. А. Носикова

Российский технологический университет – МИРЭА

Email: kochchem@mail.ru
Russian Federation, Москва

З. А. Кудряшова

Российский технологический университет – МИРЭА

Email: kochchem@mail.ru
Russian Federation, Москва

В. В. Чернышев

Институт физической химии и электрохимии РАН; Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Email: kochchem@mail.ru
Russian Federation, Москва; Москва

В. А. Тафеенко

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Email: kochchem@mail.ru
Russian Federation, Москва

С. Ф. Дунаев

Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова

Email: kochchem@mail.ru
Russian Federation, Москва

А. Ю. Цивадзе

Российский технологический университет – МИРЭА; Институт физической химии и электрохимии РАН

Email: kochchem@mail.ru
Russian Federation, Москва; Москва

References

  1. Витол В.Н., Ванаг Г.Я. // Изв. АН Латв. ССР. 1955. № 9. С. 111.
  2. Заева Г.Н., Мальцева М.М., Березовский О.И. и др. // Дезинфекционное дело. 2004. № 3. С. 58.
  3. Кочетов А.Н., Кузьмина Л.Г., Шестаков К.А. // Там же. 2009. № 2. С. 68.
  4. Kuhnert-Brandstaetter M., Wurian I., Geiler M. // Sci. Pharm. 1982. V. 50. № 3. P. 208.
  5. Озол Я.К., Зелмен В.Н., Ванаг Г.Я. // Журн. общ. химии. 1958. Т. 28. № 11. С. 3083.
  6. Палкина К.К., Кочетов А.Н., Савинкина Е.В., Аликберова Л.Ю. // Журн. неорган. химии. 2006. Т. 51. № 11. С. 1852.
  7. Кочетов А.Н., Расницын С.П., Горбунова Ю.Г. и др. // Дезинфекционное дело. 2006. № 3. С. 63.
  8. Кочетов А.Н., Носикова Л.А., Кудряшова З.А. и др. // Журн. физ. химии. 2023. Т. 97. № 6. С. 904.
  9. Заявка на изобретение РФ № 2022118523 от 07.07.2022.
  10. Заявка на изобретение РФ № 2023105751 от 13.03.2023.
  11. Sheldrick G.M. Acta Crystallogr. 2008. A. 64. 112.
  12. Brandenburg K. DIAMOND, Release 2.1d; Crystal Impact GbR: Bonn, Germany. 2000.
  13. Антипин М.Ю., Петрова М.В., Паулиньш Я.Я. и др. // Изв. АН Латв. ССР. Сер. хим. 1989. № 1. С. 102.
  14. Korp J.D., Bernal I., Lemke T.L. // Acta Cryst. B. 1980. V. 36. Р. 428.
  15. Csoregh I., Norrestamorp R. // Acta Cryst. B. 1976. V. 32. Р. 2450.
  16. Магомедова Н.С., Звонкова З.В., Гейта Л.С. и др. // Журн. структурн. химии. 1980. Т. 21. № 2. С. 131.
  17. Ahmedova A., Cador O., Sorace L. et al. // J. Coord. Chem. 2008. V. 61. P. 3879.
  18. Кочетов А.Н., Кузьмина Л.Г. // Журн. неорган. химии. 2009. Т. 54. № 2. С. 283.
  19. Палкина К.К., Кочетов А.Н. // Там же. 2010. Т. 55. № 6. С. 953.
  20. Палкина К.К., Кочетов А.Н. // Там же. 2011. Т. 56. № 6. С. 931.
  21. Varghese B., Srinivasan S., Ramadas S.R., Padmanabhan P.V. // Acta Cryst. С. 1986. V. 42. Р. 1542.
  22. Магомедова Н.С., Звонкова З.В. // Кристаллография. 1978. Т. 23. С. 281.
  23. Precigoux G., Cotrait M., Le Baut G., Leblois D., Courant J. // Acta Cryst. C. 1987. V. 43. 1391.
  24. Enchev V., Abrahams I., Angelova S., Ivanova G. // J. Mol. Struct.: Theochem. 2005. V. 719. P. 169.
  25. Yamamoto Y., Takagishi H., Itoh K. // J. Am. Chem. Soc. 2002. V. 124. P. 6844.
  26. Ide S., Kendi E., Ozbey S., Ertan N. // Acta Cry st. C. 1994. V. 50. P. 1505.
  27. Ide S., Kendi E., Ertan N. // J. Chem. Cryst. 1994. V. 24. P. 743.
  28. Kendi E., Ozbey S., Ide S., Fun H.-K., Yip B.-C. // Acta Cryst. C. 1995. V. 51. P. 1144.
  29. Song J., Mishima M., Rappoport Z. // Organic Lett. 2007. V. 9. P. 4307.
  30. Dolmella A., Gatto S., Girardi E., Bandoli G. // J. of Molecular Structure. 1999. V. 513. P. 177.
  31. Enchev V., Bakalova S., Ivanova G., Stoyanov N. // Chem. Phys. Lett. 1999. V. 314. P. 234.
  32. Bertolasi V., Gilli P., Ferretti V., Gilli G. // Chem. Eur. J. 1996. V. 2. № 8. Р. 925.
  33. Лысенко К.А., Антипин М.Ю. // Изв. АН. Сер. хим. 2001. Т. 50. № 3. С. 400.
  34. Müller-Dethlefs K., Hobza P. // Chem. Rev. V. 100. P. 143.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
2. Fig. 1. DF molecule with labelling of the most important atoms

Download (142KB)
3. Fig. 2. Result of superposition of molecules in II N and N_B (a-c)

Download (118KB)
4. Fig. 3. Packing of molecules in I. Formation of chain structures and their alignment into supramolecular formations

Download (211KB)
5. Fig. 4. Packing of molecules in IV (hydrogen atoms not shown)

Download (226KB)
6. Fig. 5. Realisation of intermolecular interactions of D-H...A-contacts for oxygen atoms in molecules of a-e polymorphic forms I, II, IV

Download (200KB)
7. Fig. 6. Packing of molecules in II (realisation of a set of VMBCs, π-π-stacking interactions and C-H...O-contacts)

Download (196KB)
8. Fig. 7. View of a fragment of molecule packing in I along the c-axis (hydrogen atoms are not shown)

Download (107KB)

Copyright (c) 2024 Russian Academy of Sciences