"Пермский медицинский журнал" основан в 1923 году. 1923-1933 гг. вышло десять номеров журнала (по 1 выпуску в год). 1934-1994 гг. – журнал не издавался как Пермский медицинский. Выходил как "Труды Пермского медицинского института" (всего 160 тематических и политематических выпусков). С 1994 года вновь выходит как "Пермский медицинский журнал" (т. 11) по четыре выпуска в год. С 2009 года ежегодно выходит 6 выпусков в год.